MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Carsonella ruddii PC isolate NHV chromosome

Total Repeats: 7231

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018418	AATAT	2	10	4	13	60 %	40 %	0 %	0 %	400404724
2	NC_018418	AT	3	6	74	79	50 %	50 %	0 %	0 %	400404724
3	NC_018418	A	9	9	103	111	100 %	0 %	0 %	0 %	400404724
4	NC_018418	A	6	6	121	126	100 %	0 %	0 %	0 %	400404724
5	NC_018418	T	6	6	131	136	0 %	100 %	0 %	0 %	400404724
6	NC_018418	ATT	2	6	141	146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404724
7	NC_018418	TA	3	6	160	165	50 %	50 %	0 %	0 %	400404724
8	NC_018418	T	8	8	182	189	0 %	100 %	0 %	0 %	400404724
9	NC_018418	ATA	3	9	239	247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404724
10	NC_018418	ATT	2	6	250	255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404724
11	NC_018418	A	7	7	259	265	100 %	0 %	0 %	0 %	400404724
12	NC_018418	A	6	6	282	287	100 %	0 %	0 %	0 %	400404724
13	NC_018418	AGAA	2	8	321	328	75 %	0 %	25 %	0 %	400404724
14	NC_018418	ATAA	2	8	370	377	75 %	25 %	0 %	0 %	400404724
15	NC_018418	GAAAAT	2	12	391	402	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	400404724
16	NC_018418	A	6	6	417	422	100 %	0 %	0 %	0 %	400404724
17	NC_018418	A	7	7	428	434	100 %	0 %	0 %	0 %	400404724
18	NC_018418	AAAT	2	8	470	477	75 %	25 %	0 %	0 %	400404724
19	NC_018418	TAA	2	6	482	487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404724
20	NC_018418	T	13	13	519	531	0 %	100 %	0 %	0 %	400404724
21	NC_018418	T	6	6	537	542	0 %	100 %	0 %	0 %	400404724
22	NC_018418	CGTT	2	8	553	560	0 %	50 %	25 %	25 %	400404724
23	NC_018418	A	6	6	562	567	100 %	0 %	0 %	0 %	400404724
24	NC_018418	TAA	2	6	578	583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404724
25	NC_018418	ATTA	2	8	588	595	50 %	50 %	0 %	0 %	400404724
26	NC_018418	ATT	2	6	601	606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404724
27	NC_018418	ATT	2	6	614	619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404724
28	NC_018418	A	8	8	621	628	100 %	0 %	0 %	0 %	400404724
29	NC_018418	TTTA	2	8	675	682	25 %	75 %	0 %	0 %	400404724
30	NC_018418	TAAC	2	8	713	720	50 %	25 %	0 %	25 %	400404724
31	NC_018418	A	6	6	735	740	100 %	0 %	0 %	0 %	400404724
32	NC_018418	TAT	2	6	741	746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404724
33	NC_018418	A	8	8	750	757	100 %	0 %	0 %	0 %	400404724
34	NC_018418	A	7	7	772	778	100 %	0 %	0 %	0 %	400404724
35	NC_018418	CAG	2	6	794	799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400404724
36	NC_018418	A	6	6	830	835	100 %	0 %	0 %	0 %	400404724
37	NC_018418	ATT	2	6	841	846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404724
38	NC_018418	ATAA	2	8	853	860	75 %	25 %	0 %	0 %	400404724
39	NC_018418	AT	3	6	914	919	50 %	50 %	0 %	0 %	400404724
40	NC_018418	TAA	2	6	945	950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404724
41	NC_018418	TAA	2	6	968	973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404724
42	NC_018418	TTAAAA	2	12	1019	1030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404724
43	NC_018418	TAA	2	6	1037	1042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404724
44	NC_018418	TTC	2	6	1050	1055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400404724
45	NC_018418	ATG	2	6	1106	1111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400404724
46	NC_018418	A	9	9	1125	1133	100 %	0 %	0 %	0 %	400404724
47	NC_018418	TAA	2	6	1134	1139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404724
48	NC_018418	TTA	2	6	1140	1145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404724
49	NC_018418	TAA	2	6	1164	1169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404724
50	NC_018418	T	7	7	1177	1183	0 %	100 %	0 %	0 %	400404724
51	NC_018418	A	7	7	1238	1244	100 %	0 %	0 %	0 %	400404724
52	NC_018418	ACAA	2	8	1270	1277	75 %	0 %	0 %	25 %	400404724
53	NC_018418	A	7	7	1276	1282	100 %	0 %	0 %	0 %	400404724
54	NC_018418	TAA	2	6	1283	1288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404724
55	NC_018418	ATT	2	6	1341	1346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404725
56	NC_018418	AGC	2	6	1379	1384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400404725
57	NC_018418	TAA	2	6	1397	1402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404725
58	NC_018418	ATT	2	6	1410	1415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404725
59	NC_018418	GGA	2	6	1464	1469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400404725
60	NC_018418	AGAATT	2	12	1493	1504	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	400404725
61	NC_018418	TAG	2	6	1538	1543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400404725
62	NC_018418	ATT	2	6	1556	1561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404725
63	NC_018418	A	6	6	1569	1574	100 %	0 %	0 %	0 %	400404725
64	NC_018418	ATAG	2	8	1605	1612	50 %	25 %	25 %	0 %	400404725
65	NC_018418	A	9	9	1652	1660	100 %	0 %	0 %	0 %	400404725
66	NC_018418	TAT	2	6	1661	1666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404725
67	NC_018418	ATT	2	6	1683	1688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404725
68	NC_018418	AAT	2	6	1691	1696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404725
69	NC_018418	A	10	10	1704	1713	100 %	0 %	0 %	0 %	400404725
70	NC_018418	TAA	2	6	1724	1729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404725
71	NC_018418	T	6	6	1737	1742	0 %	100 %	0 %	0 %	400404725
72	NC_018418	AT	3	6	1744	1749	50 %	50 %	0 %	0 %	400404725
73	NC_018418	ATT	3	9	1755	1763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404725
74	NC_018418	TTA	2	6	1780	1785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404725
75	NC_018418	AT	4	8	1794	1801	50 %	50 %	0 %	0 %	400404725
76	NC_018418	TAAA	2	8	1822	1829	75 %	25 %	0 %	0 %	400404725
77	NC_018418	A	9	9	1827	1835	100 %	0 %	0 %	0 %	400404725
78	NC_018418	A	7	7	1857	1863	100 %	0 %	0 %	0 %	400404725
79	NC_018418	ATTT	3	12	1867	1878	25 %	75 %	0 %	0 %	400404725
80	NC_018418	ATT	2	6	1918	1923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404725
81	NC_018418	A	6	6	1932	1937	100 %	0 %	0 %	0 %	400404725
82	NC_018418	ATTTTA	2	12	1981	1992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404725
83	NC_018418	AAT	2	6	1995	2000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404725
84	NC_018418	TTA	2	6	2011	2016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404725
85	NC_018418	ATA	2	6	2026	2031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404725
86	NC_018418	TAA	2	6	2036	2041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404725
87	NC_018418	A	11	11	2048	2058	100 %	0 %	0 %	0 %	400404725
88	NC_018418	TA	3	6	2074	2079	50 %	50 %	0 %	0 %	400404725
89	NC_018418	ATA	2	6	2149	2154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404725
90	NC_018418	ATC	2	6	2158	2163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400404725
91	NC_018418	T	7	7	2167	2173	0 %	100 %	0 %	0 %	400404725
92	NC_018418	AT	4	8	2202	2209	50 %	50 %	0 %	0 %	400404725
93	NC_018418	A	8	8	2245	2252	100 %	0 %	0 %	0 %	400404725
94	NC_018418	TAA	2	6	2254	2259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404725
95	NC_018418	A	8	8	2258	2265	100 %	0 %	0 %	0 %	400404725
96	NC_018418	TTATA	2	10	2285	2294	40 %	60 %	0 %	0 %	400404725
97	NC_018418	A	7	7	2342	2348	100 %	0 %	0 %	0 %	400404725
98	NC_018418	TAA	2	6	2369	2374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404725
99	NC_018418	AAC	2	6	2402	2407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400404725
100	NC_018418	GAA	2	6	2415	2420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400404725
101	NC_018418	GCA	2	6	2421	2426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400404725
102	NC_018418	GTT	2	6	2436	2441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400404725
103	NC_018418	A	7	7	2492	2498	100 %	0 %	0 %	0 %	400404725
104	NC_018418	TAA	2	6	2521	2526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404725
105	NC_018418	ATT	2	6	2591	2596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404725
106	NC_018418	ATA	2	6	2608	2613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404725
107	NC_018418	TAA	2	6	2626	2631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404725
108	NC_018418	AT	3	6	2632	2637	50 %	50 %	0 %	0 %	400404725
109	NC_018418	TTA	2	6	2639	2644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404725
110	NC_018418	ATT	2	6	2674	2679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404725
111	NC_018418	TAA	2	6	2713	2718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404725
112	NC_018418	AAAAT	2	10	2727	2736	80 %	20 %	0 %	0 %	400404725
113	NC_018418	ATA	2	6	2763	2768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404725
114	NC_018418	ATT	2	6	2769	2774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404725
115	NC_018418	AT	3	6	2792	2797	50 %	50 %	0 %	0 %	400404725
116	NC_018418	A	10	10	2799	2808	100 %	0 %	0 %	0 %	400404725
117	NC_018418	TAAA	2	8	2813	2820	75 %	25 %	0 %	0 %	400404725
118	NC_018418	AT	3	6	2849	2854	50 %	50 %	0 %	0 %	400404726
119	NC_018418	TAA	2	6	2855	2860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404726
120	NC_018418	TAT	3	9	2861	2869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404726
121	NC_018418	T	13	13	2885	2897	0 %	100 %	0 %	0 %	400404726
122	NC_018418	A	6	6	2898	2903	100 %	0 %	0 %	0 %	400404726
123	NC_018418	TAA	2	6	2904	2909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404726
124	NC_018418	TAT	3	9	2918	2926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404726
125	NC_018418	AAT	2	6	2938	2943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404726
126	NC_018418	TTA	2	6	2945	2950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404726
127	NC_018418	T	12	12	2984	2995	0 %	100 %	0 %	0 %	400404726
128	NC_018418	ATT	2	6	3003	3008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404726
129	NC_018418	TAATA	2	10	3009	3018	60 %	40 %	0 %	0 %	400404726
130	NC_018418	ATTT	2	8	3038	3045	25 %	75 %	0 %	0 %	400404726
131	NC_018418	TAA	3	9	3056	3064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404726
132	NC_018418	T	7	7	3066	3072	0 %	100 %	0 %	0 %	400404726
133	NC_018418	A	8	8	3078	3085	100 %	0 %	0 %	0 %	400404726
134	NC_018418	ATT	2	6	3133	3138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404726
135	NC_018418	T	6	6	3141	3146	0 %	100 %	0 %	0 %	400404726
136	NC_018418	AAT	2	6	3147	3152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404726
137	NC_018418	A	7	7	3169	3175	100 %	0 %	0 %	0 %	400404726
138	NC_018418	A	6	6	3184	3189	100 %	0 %	0 %	0 %	400404726
139	NC_018418	T	7	7	3201	3207	0 %	100 %	0 %	0 %	400404726
140	NC_018418	ATATTT	2	12	3228	3239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404726
141	NC_018418	TAT	2	6	3249	3254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404726
142	NC_018418	TA	3	6	3268	3273	50 %	50 %	0 %	0 %	400404726
143	NC_018418	CTTTAT	2	12	3281	3292	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	400404726
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